Zaets, I.YE.Podolich, O.V.Reva, Oleg N.Kozyrovska, Natalia2016-06-102016-06-102016Zaets, IYE, Podolich, OV, Reva, ON & Kozyrovska, NO 2016, 'DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare', Biopolymers and Cell, vol. 32, no. 1, pp. 3-8.0233-7657 (print)1993-6842 (online)10.7124/bc.000906http://hdl.handle.net/2263/53042High-throughput sequencing allows obtaining DNA barcodes of multiple species of microorganisms from a single environmental sample. Next Generation Sequencing (NGS)-based profiling provides new opportunities to evaluate the human health effect of microbial community members affiliated to probiotics. DNA metabarcoding may serve as a quality control of microbial communities, comprising complex probiotics and other fermented foods. A detailed inventory of complex communities is a pre-requisite of understanding their functionality as whole entities that makes it possible to design more effective bio-products by precise replacement of one community member by others. The present paper illustrates how the NGS-based DNA metabarcoding allows profiling of both wild and hybrid multi-microbial communities with the example of a kombucha probiotic beverage fermented by yeast-bacterial partners.Високопродуктивне секвенування дозволяє отримати штрих- коди ДНК декількох видів мікроорганізмів з однієї проби на- вколишнього середовища. Профілювання видів на основі тех- нологій секвенування нового покоління (СНП) дає нові мож- ливості для оцінки впливу членів мікробних угрупувань про- біотиків на здоров’я людини. Метабаркодинг ДНК може слу- гувати для контролю якості мікробних угрупувань, включаючи складні пробіотики та інші ферментовані продукти. Детальна інвентаризація складних угрупувань є передумовою розуміння їх функціональності як цілісного утворення, що дасть можли- вість створювати більш ефективні біо-продукти шляхом точної заміни одного з членів угрупування/спільноти іншими. Ця стаття показує, як можна застосувати метабаркодинг ДНК на основі СНП для профілювання диких і гібридних мульти-мі- кробних угрупувань на прикладі пробіотичного напою комбу- чі, ферментованого дріжджово-бактеріальними партнерами.Высокопродуктивное секвенирование позволяет получить штрих-коды ДНК нескольких видов микроорганизмов из одной пробы окружающей среды. Профилирование видов на основе технологий секвенирования нового поколения (СНП) дает но- вые возможности для оценки влияния микробных членов сооб- ществ пробиотиков на здоровье человека. Метабаркодинг ДНК может служить для контроля качества микробных сообществ, включая сложные пробиотики и другие ферментированные про- дукты. Детальная инвентаризация сложных сообществ является предпосылкой понимания их функциональности как целостно- го образования, давая возмлжность создавать более эффектив- ные био-продукты с помощью точной замены одного из членов сообщества другими. Эта статья показывает, как можно исполь- зовать метабаркодинг ДНК на основе СНП для профилирования диких и гибридных мульти-микробных сообществ на примере пробиотического напитка комбучи, ферментированного дрож- жево-бактериальными партнерами.en© 2016 I. Ye. Zaets et al.; Published by the Institute of Molecular Biology and Genetics, NAS of Ukraine on behalf of Biopolymers and Cell. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).DNA metabarcodingMicrobial communitiesHealthcareProbioticsметабаркодинг ДНКмікробні угрупу-охорона здоров’япробіотикиметабаркодинг ДНКмикробные сооб-ществаохрана здоровьяпробиотикиArticle