Pathogen detection and disease diagnosis in wildlife : challenges and opportunities

Abstract

Recent decades have witnessed an increase in the demand for pathogen detection and other diagnostic approaches for wild animal populations as interest has grown in infectious diseases that occur in wildlife. This is partially as a result of human population encroachment into wildlife habitats, efforts to protect vulnerable wildlife populations and an increased commercial use of wildlife. As contact rates increase, so does the spillover risk of pathogens between wildlife, domestic animals and humans. The challenges encountered when developing and validating diagnostic tests for use in wildlife are manifold and primarily centre on issues concerning diagnostic samples and suitable test approaches. Under these constraints, it is tempting to resolve the situation by adopting diagnostic tests validated for domestic animal species. Numerous examples using this approach have been published in the literature and some are presented in this paper. The authors present scenarios highlighting advantages and disadvantages of different types of tests in wildlife and current impediments to their validation. Special attention is drawn to future perspectives with regard to the potential of novel and innovative technologies to improve detection of existing, and discovery of unknown, pathogens as well as to accelerate our understanding of infectious wildlife diseases and their diagnosis.Nous assistons depuis quelques décennies à une augmentation de la demande en matière de détection des agents pathogènes et d’approches diagnostiques applicables aux populations de la faune sauvage, parallèlement à un intérêt accru pour les processus infectieux chez les animaux sauvages. Cette évolution résulte en partie de l’empiètement des populations humaines sur les habitats de la faune sauvage, des efforts déployés pour protéger les populations d’animaux sauvages vulnérables et d’une intensification du commerce axé sur la faune sauvage. À mesure que les contacts se multiplient, le risque d’un franchissement de la barrière d’espèces et d’une transmission des agents pathogènes des animaux sauvages aux animaux domestiques et à l’homme s’accroît également. La mise au point et la validation d’épreuves diagnostiques destinées à la faune sauvage se heurtent à de multiples difficultés dont en premier lieu la problématique des échantillons à analyser et des méthodes d’essai appropriées. Compte tenu de ces contraintes, la tentation est grande de résoudre le problème en faisant appel à des épreuves diagnostiques validées pour les espèces animales domestiques. Le recours à cette solution est illustré par d’abondants exemples dans la littérature, dont certains sont rappelés ici. Les scénarios présentés par les auteurs mettent en avant les avantages et les inconvénients d’un certain nombre de tests de différents types utilisés chez les animaux sauvages, ainsi que les obstacles qui empêchent de les valider. Une attention particulière est accordée aux perspectives ouvertes par le potentiel d’innovation des nouvelles technologies, qui annoncent une meilleure détection des agents pathogènes existants ainsi que la possibilité d’en découvrir de nouveaux, d’accroître notre connaissance sur les maladies infectieuses de la faune sauvage et d’accélérer leur diagnostic.En los últimos decenios, a medida que crecía el interés por las enfermedades infecciosas que se dan en la fauna silvestre, también iba aumentando la demanda de soluciones para poder detectar patógenos o aplicar otros métodos de diagnóstico en las poblaciones de animales silvestres. Este interés se explica, en parte, por la intrusión humana en los hábitats de la fauna silvestre, los esfuerzos por proteger a las poblaciones silvestres vulnerables y la creciente utilización comercial de la fauna silvestre. A medida que el frote se intensifica, también aumenta el riesgo de transmisión de patógenos entre animales silvestres, animales domésticos y personas. Las diversas y numerosas dificultades que han surgido a la hora de concebir y validar pruebas de diagnóstico para animales silvestres tienen que ver primeramente con las cuestiones de las muestras de diagnóstico y los métodos analíticos adecuados. Ante semejantes limitaciones, es tentador salvar el obstáculo recurriendo a pruebas de diagnóstico validadas para especies de animales domésticos. La bibliografía abunda en ejemplos de este tipo de soluciones, algunos de ellos descritos aquí por los autores, que también presentan situaciones hipotéticas para exponer las ventajas y desventajas de distintos tipos de prueba en la fauna silvestre y los impedimentos que hoy frenan su validación. Los autores destacan las perspectivas futuras que se abren con nuevas y novedosas tecnologías que traen consigo la posibilidad de mejorar la detección de los patógenos existentes y el descubrimiento de otros por ahora desconocidos y de ahondar rápidamente en nuestro conocimiento de las enfermedades infecciosas de la fauna silvestre y su diagnóstico.