High-throughput sequencing allows obtaining DNA barcodes of multiple species of microorganisms from a
single environmental sample. Next Generation Sequencing (NGS)-based profiling provides new opportunities
to evaluate the human health effect of microbial community members affiliated to probiotics. DNA metabarcoding
may serve as a quality control of microbial communities, comprising complex probiotics and other
fermented foods. A detailed inventory of complex communities is a pre-requisite of understanding their functionality
as whole entities that makes it possible to design more effective bio-products by precise replacement
of one community member by others. The present paper illustrates how the NGS-based DNA metabarcoding
allows profiling of both wild and hybrid multi-microbial communities with the example of a kombucha probiotic
beverage fermented by yeast-bacterial partners.
Високопродуктивне секвенування дозволяє отримати штрих-
коди ДНК декількох видів мікроорганізмів з однієї проби на-
вколишнього середовища. Профілювання видів на основі тех-
нологій секвенування нового покоління (СНП) дає нові мож-
ливості для оцінки впливу членів мікробних угрупувань про-
біотиків на здоров’я людини. Метабаркодинг ДНК може слу-
гувати для контролю якості мікробних угрупувань, включаючи
складні пробіотики та інші ферментовані продукти. Детальна інвентаризація складних угрупувань є передумовою розуміння
їх функціональності як цілісного утворення, що дасть можли-
вість створювати більш ефективні біо-продукти шляхом точної
заміни одного з членів угрупування/спільноти іншими. Ця
стаття показує, як можна застосувати метабаркодинг ДНК на
основі СНП для профілювання диких і гібридних мульти-мі-
кробних угрупувань на прикладі пробіотичного напою комбу-
чі, ферментованого дріжджово-бактеріальними партнерами.
Высокопродуктивное секвенирование позволяет получить
штрих-коды ДНК нескольких видов микроорганизмов из одной
пробы окружающей среды. Профилирование видов на основе
технологий секвенирования нового поколения (СНП) дает но-
вые возможности для оценки влияния микробных членов сооб-
ществ пробиотиков на здоровье человека. Метабаркодинг ДНК
может служить для контроля качества микробных сообществ,
включая сложные пробиотики и другие ферментированные про-
дукты. Детальная инвентаризация сложных сообществ является
предпосылкой понимания их функциональности как целостно-
го образования, давая возмлжность создавать более эффектив-
ные био-продукты с помощью точной замены одного из членов
сообщества другими. Эта статья показывает, как можно исполь-
зовать метабаркодинг ДНК на основе СНП для профилирования
диких и гибридных мульти-микробных сообществ на примере
пробиотического напитка комбучи, ферментированного дрож-
жево-бактериальными партнерами.
