Avian gyrovirus 2 and avirulent Newcastle disease virus coinfection in a chicken flock with neurologic symptoms and high mortalities

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dc.contributor.author Abolnik, Celia
dc.contributor.author Wandrag, D.B.R. (Daniel)
dc.date.accessioned 2014-05-23T10:32:11Z
dc.date.available 2014-05-23T10:32:11Z
dc.date.issued 2014
dc.description.abstract A disease with severe neurologic symptoms caused 100% mortality in a small broiler operation in the Gauteng Province, South Africa in late March 2013. Routine diagnostic PCR testing failed to identify a possible cause of the outbreak; thus, samples were submitted for virus isolation, serology, and bacteriology. An avirulent Newcastle disease virus (NDV) strain isolated was identified as a V4-like genotype 1 strain, by DNA sequencing, with a cleavage site of 112GKQGRQL117. Real-time reverse transcription PCR identified NDV in the brain but not in cecal tonsils or pooled tracheas, spleens, lungs, and livers. A random amplification deep sequencing of a transcriptome library generated from pooled tissues produced 927,966 paired-end reads. A contig of 2,309 nucleotides was identified as a near-complete avian gyrovirus 2 (AGV2) genome. This is the first report on the African continent of AGV2, which has been reported in southern Brazil, the Netherlands, and Hong Kong thus far. A real-time PCR for AGV2 only detected the virus in the brain but not in cecal tonsils or pooled tracheas, spleens, lungs, and livers. Sequence reads also mapped to the genomes of mycoplasma, Escherichia coli, avian leukosis virus subtype J, and Marek’s disease virus but excluded influenza A virus, Ornithobacterium rhinotracheale, avian rhinotracheitis virus, avian encephalomyelitis virus, and West Nile virus. Air sac swabs were positive on bacterial culture for E. coli. The possibility of a synergistic pathogenic effect between avirulent NDV and AGV2 requires further investigation. en
dc.description.abstract Una enfermedad con signos neurolo´gicos graves causo´ una mortalidad del 100 % en una operacio´n pequen˜a de pollos de engorde en la provincia de Gauteng, en Suda´frica a finales de marzo del 2013. Las pruebas rutinarias de diagno´stico por PCR no lograron identificar una posible causa del brote, por lo que las muestras fueron sometidas al aislamiento viral, serologı´a y bacteriologı´a. Se aislo´ e identifico´ un virus de la enfermedad de Newcastle no virulento (NDV) como una cepa similar al genotipo 1 V4, por secuenciacio´n de ADN, en el sitio de disociacio´n 112GKQGR Q L117. Mediante un me´todo de transcripcio´n reversa y PCR en tiempo real se identifico´ la presencia del virus de Newcastle en el cerebro, pero no en las tonsilas cecales o en las muestras agrupadas de tra´quea, bazo, pulmones, e hı´gado. Una amplificacio´n con secuenciacio´n profunda y aleatoria de una biblioteca de transcriptoma generada a partir de muestras agrupadas de tejidos produjo 927,966 lecturas emparejadas. Se identifico´ un contig de 2309 nucleo´tidos como un genoma casi completo de un Gyrovirus aviar 2 (AGV2). Este es el primer informe en el continente africano de la presencia del AGV2, que se ha reportado hasta el momento en el sur de Brasil, los Paı´ses Bajos y Hong Kong. Un me´todo de PCR en tiempo real para AGV2 so´lo detecto´ al virus en el cerebro, pero no se detecto´ en las tonsilas cecales, o en las muestras agrupadas de tra´quea, bazos, pulmones e hı´gado. Las lecturas de las secuencias tambie´n se relacionaron con el genoma de mycoplasma, Escherichia coli, con el virus de la leucosis aviar subtipo J, y con el virus de la enfermedad de Marek, pero excluyo´ al virus de la influenza A, Ornithobacterium rhinotracheale, al virus de la rinotraqueı´tis aviar, al virus de la encefalomielitis aviar y al virus del Nilo Occidental. Los hisopos de sacos ae´reos fueron positivos para el cultivo bacteriano de E. coli. La posibilidad de un efecto patoge´nico sine´rgico entre el virus de Newcastle avirulento y el AGV2 requiere de ma´s investigacio´n. en
dc.description.librarian am2014 en
dc.description.librarian ab2014
dc.description.uri http://www.aaapjournals.info/loi/avdi en
dc.identifier.citation Abolnik, C & Wandrag, DBR 2014, 'Avian gyrovirus 2 and avirulent Newcastle disease virus coinfection in a chicken flock with neurologic symptoms and high mortalities', Avian Diseases, vol. 58, pp. 90-94. en
dc.identifier.issn 0005-2086 (print)
dc.identifier.issn 1938-4351 (online)
dc.identifier.other 23093208700
dc.identifier.other N-9324-2014
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/2263/39899
dc.language.iso en en
dc.publisher American Association of Avian Pathologists en
dc.relation.requires Adobe Acrobat Reader en
dc.rights American Association of Avian Pathologists en
dc.subject Avian gyrovirus en
dc.subject Polymerase chain reaction (PCR) en
dc.subject Genome en
dc.subject.lcsh Newcastle disease virus (NDV) en
dc.subject.lcsh Chickens -- Diseases en
dc.title Avian gyrovirus 2 and avirulent Newcastle disease virus coinfection in a chicken flock with neurologic symptoms and high mortalities en
dc.title.alternative Coinfeccio´n entre el gyrovirus aviar 2 y el virus de la enfermedad de Newcastle avirulento en una parvada de pollo de engorde con signos neurolo´gicos y alta mortalidad en
dc.type Article en


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